PROPAGACIÓ DELS CULTIUS: Comença a un tub d'assaig o liofilitzat on es conserva la cepa d'interès o la colònia de microorganismes prèviament seleccionada, propagant progressivament aquesta colònia pel medi de cultiu.

FERMENTACIÓ: Es prepara el medi de nutrients i s'esterilitza per evitar contaminacions i posteriorment es sembra.

SEPARACIÓ I PURIFICACIÓ: Són les operacions mecàniques de trencament de cèl·lules, separació primaria per extracció líquid-líquid, extracció en dues fase aquoses o cromatografia d'afinitat, aïllament i condicionament del producte.

TRACTAMENT D'AFLUENTS: No té a veure directament amb el producte, però és una etapa imprescindible per a preservar el medi alhora de no contaminar amb els residus.